L'Archivio conserva le carte dell'Istituto Storico Germanico di Roma e degli enti predecessori dalla fondazione, avvenuta nel 1888, fino al presente e ne documenta sia l'attività amministrativa interna che il lavoro scientifico. Molteplici lasciti completano tali materiali. Infine l'Archivio possiede alcuni fondi particolari, tra cui una raccolta di fotografie storiche di gran valore.